Родился 21 сентября 1946 года в Ленинграде. Отец, Валентин Михайлович Ковальчук (1916-2013)- историк, специалист по истории блокады Ленинграда, являлся научным сотрудником Ленинградского отделения Института истории АН СССР; мать работала преподавателем исторического факультета Ленинградского государственного университета. Младший брат — Юрий Ковальчук