Через семь лет после оккупации Японии Священной Британской империей Лелуш Ламперуж случайно оказывается в стычке между террористами «одиннадцатых» и британской армией. Волею судьбы он встречает загадочную девушку, которая спасает его от смерти

Лелуш атакует британскую армию в Синдзюку, предоставив группе повстанцев «одиннадцатых» несколько боевых машин Knightmare Frame (KF) и стратегическую поддержку

Перед тем, как убить Кловиса, Лелуш спрашивает о том, кто убил его мать. Позже он обнаруживает, что Карен (одна из террористов, которым он помог сражаться против империи) учится в Академии Ашфорд, и узнает об ограничениях в своей силе

Пуристы Британской Армии обвиняют Судзаку в убийстве Кловиса. С помощью Каллен и Оги Лелуш придумывает план спасения Судзаку, своего друга детства. Взяв псевдоним «Зеро», Лелуш публично объявляет, что именно он убил принца Кловиса

К большому удивлению Лелуша, C.C. выжила и снова нашла его. Тогда же время освобождённый Судзаку встречает третью принцессу империи Евфимию, в то время как вторая принцесса империи Корнелия, приезжает в Японию чтобы найти и захватить Зеро

Судзаку начинает своё обучение в Академии Ашфорд и сталкивается с презрением студентов-британцев. Корнелия продолжает свою охоту на Зеро. Бродячий кот проникает в резиденцию Ламперуж и случайно надевает маску Зеро

Генерал-губернатор Корнелия создает такую же ситуацию, как и в Синдзюку, с целью выманить Зеро. Лелуш принимает вызов, С.С. пробует остановить его, но он угрожает ей, что застрелится, если она его не отпустит

Повстанцы под командованием Оги-сана получают новый огромный трейлер, который становится их базой. Повстанцы из организации «Японский Освободительный Фронт» захватывают отель, в котором находятся члены Студенческого совета и принцесса Евфимия

Рассказанный от лица Карен эпизод повествует о её взаимоотношениях с матерью и операции Чёрных Рыцарей по уничтожению склада с наркотиком «Рефрен»

Орден получает подарок от «Киото» в виде KF. На горной цепи Нариты происходит битва между Японским Освободительным Фронтом и армией Британии. Орден помогает Японскому Освободительному Фронту, создав огромный оползень, и также объединяется с ними

Нападение Черных рыцарей на британскую армию в Нарите оказывается успешным, и Каллен и Лелуш загоняют Корнелию в угол. По просьбе Юфимии Сузаку бросается на поле битвы в Ланселоте, чтобы спасти Корнелию

Зеро и основные члены Черных рыцарей встречаются с Тайзо Кирихарой, одним из самых влиятельных людей в японском подполье и знакомым Лелуша с его юных лет в храме Куруруги

Ширли тайно следует за Лелушем и становится свидетелем битвы между Фронтом освобождения Японии и британской армией, которую Лелуш заканчивает тем, что взрывает воспламеняющийся сакурадит

Лелуш считает, что Ширли, возможно, раскрыла его личность как Зеро, поэтому он и Си Си преследуют её до Нариты. Огги исследует поле боя, обнаруживая раненую Виллетту Ну, оставленную умирать вне поля зрения

Оги находит раненую Вилетту, которая теряет память. Мао устраивает ловушку для С.С. в парке. Лулу спасает её и при этом натравливает на Мао полицию, отдав приказ стрелять в него

Мао выжил и похитил Нанналли, чтобы заманить Лелуша к себе. Судзаку случайно узнаёт об этом и пытается помочь другу. Лелуш использует на себе гиасс, чтобы ввести Мао в заблуждение

Зеро штурмует тюрьму, где сидит генерал Тодо, и спасает его. Также он узнает, кто управляет KF «Ланселот». Принцесса Евфимия выбирает пилота «Ланселота» своим рыцарем

Реорганизация в рядах Ордена Чёрных Рыцарей. Судзаку становится рыцарем принцессы Евфимии. Битва на острове, в результате которой «Ланселот» обездвижен

Лелуш, Судзаку, Евфимия и Карен оказываются на необитаемом острове, разбившись на пары. Евфи увидев Зеро, назвала его Лелушом, и тот снял маску. Судзаку, узнав, что Карен состоит в Ордене Чёрных Рыцарей, арестовал её

Группа Савасаки, чиновника последнего японского правительства, захватив при поддержке Китайской Федерации Фукуоку, Нагасаки и Оиту, объявила о восстановлении независимости Японии. Судзаку отказывается от титула

Зеро готовит переворот. В Академии Ашфорд проходит фестиваль, на котором присутствуют Оги-сан с Вилеттой, Карен, С. С., а также принцесса Евфимия, которая случайно встречается с Нанналли

Принцесса Евфимия приглашает Зеро на церемонию по поводу создания нового региона. Зеро прибыл и был готов заключить соглашение с Евфи, но случайно использовал свой Гиасс

Судзаку возвращается в «Авалон» со смертельно раненной Евфимией, которую подстрелил Зеро. Зеро анонсирует образование Соединённых Штатов Японии. Он сожалеет о своих действиях, и С.С. утешает его. Вся Зона-11 восстает против Британии

Начинается штурм Токийского Поселения. Британская армия из последних сил обороняет здание правительства. Орден Чёрных Рыцарей по приказу Зеро организует штаб в академии Ашфорд

Принцесса Корнелия узнаёт, что за маской Зеро скрывается её брат. Лелуш использует на ней гиасс, и выясняет, что его убитая мать Марианна сама отозвала охрану в день своей смерти. После этого С.С. говорит ему, что Нанналли похитили