Во время командировки в море для своей компании Рокуро Окадзима похищен членами компании «Лагуна»: Датчем, Реви и Бенни. Получив информацию для русской мафии Реви берет Рокуро в качестве заложника на свой корабль «Чёрная лагуна» для получения выкупа

Рок разрабатывает план по уничтожению боевого корабля, который, кажется, поймал «Чёрную лагуну». Тем временем компания «Лагуна» принимает Рока в качестве нового члена

Гангстер по имени Чин заманивает Датча и команду «Чёрной лагуны» в морскую битву против Луака, лидера соперничающих пиратов

Во время миссии по извлечению ценной картины с затонувшей подводной лодки «Чёрная лагуна» осаждена неонацистами, стреляющими ракетами

Найдя картину на затонувшей подводной лодке, Рок и Реви спорят о поисках дополнительной добычи, в то время как водолазы неонацистов приближаются к месту крушения

Жестокий рейд Датча и Реви на неонацистский корабль приводит к неожиданным разоблачениям о Реви и миссии «Чеёрной лагуны» по возвращению картины

Негодование Реви по поводу того, что его отправили на задание к Року, может измениться, когда он уладит потенциально взрывоопасную ситуацию с дилером

Экипаж «Чёрной лагуны» должен доставить молодого заложника колумбийскому картелю, но у Датча угрызения совести, когда он узнает личность мальчика

Команда «Чёрной лагуны» слишком поздно обнаруживает, что Роберта — грозный противник с наградой за её голову, когда они пытаются бежать с Гарсией

Рок узнает правду о войсках Балалайки, когда они вмешиваются в бескомпромиссную конфронтацию между Реви и Робертой

Передавая информацию о террористической организации в ЦРУ, экипаж «Чёрной лагуны» подвергается нападению террористов

Рок узнает правду о Такенаке во время допроса и получает ещё больший сюрприз после того, как его спасают Реви и Шэньхуа